1981

1981年7月，广州市社会科学研究所——广州市社会科学院的前身，正式挂牌成立。创办之初的社科所，只有办公室、经济研究室、历史研究室、社会问题研究室和情报资料室5个机构，人员编制50名。

从1982年至1989年间，社科所先后成立了《广州研究》（1988年改称《开放时代》）编辑部、《广州经济年鉴》编辑部（1985年改称《广州年鉴》编辑部，代管机构）、广州市社会科学学会联合会（合署办公）、城市管理研究室、太平天国研究中心（后并入历史研究室）、科研管理处，另外还有几个实行企业管理的经济实体：软科学开发服务公司、博利公共关系公司、新利堡消防工程企业有限公司和中南会计师事务所等，共14个机构。

1989

1989年8月，广州市社会科学研究所改称广州市社会科学院，此时，事业编制已增至85名。

1990年至2002年，先后增设了哲学文化研究所（增挂岭南文化研究中心牌子）、发展研究所、政治法律研究室、科技开发部（后与科研管理处合并为科研开发管理处）、机关党委、人事处、股份经济研究所、国际经济社会文化研究所、金融研究所、数量经济与技术经济研究所，经济研究室、历史研究室均改称研究所。

其间，还成立了岭南文化研究中心、广州市市场经济研究发展中心、交际文化中心，创办了《股市导报》杂志社，设立纪检组、监察室（合署办公）、对外学术交流处。

根据上级有关文件精神，从1998年至2000年，对院所有下属经营性机构进行了撤销和清理。

2003

2003年7月15日，根据市编委会、市委宣传部、市委政策研究室、市计委《关于印发〈广州市社会科学院与广州市经济研究院合并方案〉的通知》（穗编办[2003]98号文），原广州市社会科学院与原广州市经济研究院合并，组建新的广州市社会科学院，同时撤消广州经济社会发展研究中心，其承担的职能并入新的广州市社会科学院。

根据穗编字[2006]文，社科院设立办公室、人事处（外事处）、科研处、哲学研究所、社会学与社会政策研究所、历史研究所、经济研究所、区域经济研究所、城市管理研究所、现代市场研究所、数量经济研究所（经济决策仿真实验室）、金融研究所、产业经济与企业管理研究所、国际问题研究所、软科学研究所、政治法律研究所、出版编辑中心、文献信息中心等18个内设机构，人员编制171个。

2008

2008年10月29日，根据市编委会《关于<珠江经济>杂志划归市社科联主管主办问题的批复》（穗编字[2008]375号），原由市社科院所办的《珠江经济》杂志划归市社科联主管主办。所需6名人员编制和1名副处级领导职数从市社科院划转。市社科院事业编制由171名减为165名。